Discrepancias en el número total actual de municipios

Es de notar que la cifra total de estas subdivisiones territoriales varia en el registro de cada una de las entidades gubernamentales que se encargan de su manejo; esto se debe a varias razones, principalmente, a que en los últimos 5 años se han venido elevando y suprimiendo diversos municipios sin un control debido por parte de las gobernaciones, o a que en algunos casos unas consideran municipio a un territorio solo cuando lo incluyen en el situado fiscal, y otras, cuando se ha hecho un referendo y la mayoría de los consultados vota a favor de la creación de la municipalidad. 

Es así, por ejemplo que en el Ministerio del Interior figuran 1.002,para la Registraduría Nacional son 1.003 y para Planeación Nacional y el DANE 1.123. Sin embargo, los municipios realmente se crean mediante ordenanzas de las asambleas departamentales.